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内容来源：我赢网所属栏目：热点更新日期：2024-11-26

r包下载

「以闪亮之名超话」「以闪亮之名」穿越长假，福利火拼！谁偷走了我的假期！怎么一闭眼就到假期最后一天了！谁偷走了我的假期（跑来跑去）谁啊（仰天长啸）是不是你偷了我的富二代人生（揪住衣领）说啊是不是你（狠狠盯住）什么？不是你？（十分不解）那是谁偷走了我的假期是谁啊（继续奔跑） ❗️不过没关系，Summer会施展一些“假期延长术”帮大家延伸假期的快乐！卷发+关注，Summer将从铁粉中抽取5位合伙人每人送出【现金红包3000r】，包治百病的包就是红包的包❗️ 𐟒Ž下载传送门：网页链接 𐟒Ž闪亮作品上映季活动传送门：网页链接

TCGA数据揭秘，从零到热图！想要深入了解肿瘤和正常组织在基因层面的差异吗？𐟔𐟧젔CGA（The Cancer Genome Atlas）是全球最大的癌症基因组数据库，涵盖了多种癌症的基因表达和突变数据。今天，我们将带你从零开始，探索如何下载和使用TCGA数据，进行差异基因分析！𐟒𛊊𐟓Œ 步骤概览： TCGA数据库简介：TCGA是全球最大、最权威的癌症基因组数据库，涵盖了多种癌症的基因表达、突变等数据。数据下载：你可以使用R包TCGAbiolinks或直接访问GDC（Genomic Data Commons）门户，下载特定癌症类型的RNA-seq表达矩阵。差异分析：使用DESeq2、edgeR、limma等R包对正常组织和肿瘤组织的基因表达进行差异分析。筛选出上调和下调的差异基因，并输出热图、PCA图和火山图。 𐟓Š 应用方向：癌症标志物的发现：通过差异表达基因，找到潜在的癌症标志物，用于临床诊断和治疗。药物靶点的开发：差异表达基因也可以帮助我们发现新药物的潜在靶点，加速药物研发进程。 𐟑颀𐟔젩€‚合人群：生物信息学初学者医学研究者对癌症基因组感兴趣的科研人员赶快动手吧！𐟒ꠦŽ⧴┃GA数据的奥秘，开启你的癌症基因组研究之旅！

GEO2R结果探针ID转基因符号指南𐟔슥œ褽🧔臅O2R对GEO数据集进行分析后，结果常常只包含探针ID，而缺乏基因名称（gene symbol）。因此，进行基因重注释是非常必要的。以下是几种获取基因注释信息的方法： 1️⃣ GEO官网：从GEO官网下载的注释文件中，通常包含基因ID和基因符号信息，可以直接进行比对，简单快捷。 2️⃣ bioconductor包：使用AnnoProbe包，该包覆盖了大部分数据集的注释需求，大多数情况下可以一键搞定。 3️⃣ 基因芯片公司官网：如果GEO官网和AnnoProbe包中没有所需的注释信息，可以尝试从基因芯片公司官网获取文件，或者联系数据集作者获取更多注释信息。图3和图4展示了使用AnnoProbe包和直接使用GPL数据进行注释的两种方法，它们能够覆盖大部分的数据集。在实际使用时，请确保替换示例中的图3和图4，以确保笔记内容的准确性和完整性。

Python汉化全攻略𐟔劰Ÿš€ 安装Python解释器下载Python 3.7.8的安装包（asm64.exe）。勾选“Add Python 3.7 to PATH”选项。点击“Install Now”按钮。安装完成后，按下Win+R键，输入“cmd”并回车。在控制台中输入“python”并回车，如果能看到“Python 3.7.8 (...) on win64”的提示，说明安装成功。 𐟓š 安装PyCharm 下载PyCharm Community Edition的安装包（pycharm-community-2022.2.exe）。选择自定义安装路径，建议不要安装在C盘。勾选“PyCharm Community Edition”选项。勾选“Add 'bin' folder to the PATH”选项。点击“Install”按钮。 𐟌 汉化PyCharm 打开PyCharm，进入“Plugins”页面。搜索并安装“汉化包”（Chinese (Simpl））。安装完成后，点击“Restart IDE”按钮。 𐟓‹ 新建项目返回“Project”页面，点击“新建项目”。勾选“默认全局...软件包”和“可用于所有项目”选项。点击“创建”按钮。 𐟖‹️ 开始编程创建项目后，删除main文件中的内容，就可以开始编写代码了。𐟎‰

Anaconda：Python新宠！ 𐟚€ 不要再直接安装Python了，Anaconda是你的新伙伴！ 𐟓š Anaconda介绍 Anaconda是一个广受欢迎的开源数据科学平台，特别适合Python和R语言开发者。它被广泛应用于数据科学、机器学习、人工智能以及科学计算等领域。Anaconda提供了便捷的包管理和环境管理功能，使用户能够在一个系统上轻松管理多个项目和依赖包。 𐟛 ️ Anaconda安装你可以在Anaconda官网下载安装包，填写邮箱后官方会发送安装包给你。下载后打开安装包，按照提示进行安装。建议将文件路径放在非C盘，然后按照默认设置进行安装。 𐟓– Anaconda使用 Anaconda支持Python和R语言，提供了图形化界面，方便新手管理包。它还能将各种Python环境隔离开来，方便切换不同的Python版本环境。 𐟑堥…𖤻–IDE使用Anaconda 许多其他IDE也支持Anaconda，如PyCharm、Visual Studio Code等。这些工具可以与Anaconda集成，提供更便捷的开发体验。 𐟌Ÿ 希望这些信息能帮助你更好地使用Anaconda，提升开发效率！

MUDAN包安装全攻略：从零开始到成功昨晚为了安装MUDAN包，我可是费了好一番功夫。试了各种方法，从自带install到biomanager，再到github，最后发现只能用local。而且，你还得先自己把所有依赖的包都装好。真是让人头大！各种尝试首先，我尝试了最简单的方法——直接用R自带的install函数。结果发现根本不行，包根本找不到。于是，我又试了biomanager，结果还是不行。然后我又跑到github上找，还是没能成功。最后，我终于找到了一个方法——用local安装。 local安装法这个方法其实也不简单。你需要先下载MUDAN包的源代码，然后手动安装。具体步骤是这样的：打开RStudio。运行library(devtools)。使用devtools::install_local函数，指向你下载的MUDAN-master.zip文件。这样，你就能成功安装MUDAN包了。不过，这个过程真的很麻烦，尤其是对于那些没有太多编程经验的人来说。小结总的来说，安装MUDAN包真是一个不小的挑战。虽然过程有点曲折，但最终我还是成功了。如果你也在为安装MUDAN包而头疼，不妨试试我的方法，希望能帮到你！𐟒ꀀ

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研1挑战12天：掌握概率模型与统计 𐟓š 学习进度： 1️⃣ 探索了各种常见的概率模型，包括离散型和连续型，如二项分布、几何分布、泊松分布、正态分布、指数分布和T分布等。 2️⃣ 掌握了常见统计量的计算，如方差、分位数、升序和降序排列，以及多元数据的均值计算。 𐟒ᠦ€𛧻“：今天主要补充了概率论与统计的相关知识。原本计划用R语言绘制进化树，但遇到了ggtree包无法直接安装的问题，早上尝试了多种方法但未能成功。 𐟓š 目前在看的资源：章鱼叔叔的R语言统计学部分，主要讲解统计与概率知识在R中的应用。 𐟤” 今日疑问： ggtree包的下载问题，据说需要先下载依赖包才能成功安装。尝试了多种方法后仍报错，决定明天尝试用R包源代码下载。 𐟘… 希望明天能顺利解决这个问题，继续前进！

鸣潮超话 26个G的预下载包？r u okay？鸣潮1.3版本

构建进化树的过程学习进度𐟓š 1⃣️ 尝试了多种方法安装ggtree包，包括install.packages()和BioManager，但都未能成功。最终选择了源代码安装，速度较快。 2⃣️ 掌握了使用ggtree R包绘制简单进化树的技巧。目前在用的资源[星R] 在R语言绘制进化树方面，我参考了某站up小明的数据分析笔记本，按照他的方法和代码进行操作。最初难以下载ggtree包，尝试了多种方法后，最终通过查询AI如何用源代码安装，成功解决了问题。最近在尝试使用AI解决问题，无论是课程预习还是学习R语言中遇到的代码问题，AI都能提供可行的解决方案。 AI应用体验𐟤– 最近，我表妹咨询我关于AI PC的选择意见。不得不说，现在AI已经深入各行各业了。我在京东打字~笔记本换新季~中看到了像联想小新Pro16、华硕灵耀14这些不错的AI本。最终，我帮她挑选了小新，它内置的本地AI助手和一秒生图功能非常实用。 AI挑战大赛𐟏† 目前，我还参加了英特尔AI挑战大赛。只要在红薯上发布自己与AI的故事和作品，并带上#酷睿Ultra校园神器标签，就可以参加。不仅可以欣赏到大佬们的创意AI作品，还有机会获得618元大奖！我已经提交了参赛作品，感兴趣的同学请注意截止时间，不要错过哦～

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